Mus musculus Protein: Smg5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-160315.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smg5 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000001451 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-160313 (Smg5) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays a role in nonsense-mediated mRNA decay. Does not have RNase activity by itself. Promotes dephosphorylation of UPF1. Together with SMG7 is thought provide a link to the mRNA degradation machinery involving exonucleolytic pathways, and to serve as an adapter for UPF1 to protein phosphatase 2A (PP2A), thereby triggering UPF1 dephosphorylation. Necessary for TERT activity (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus {ECO:0000250}. Note=Detected in cytoplasmic mRNA decay bodies. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2447364 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002716
PIN domain IPR019458 Telomerase activating protein Est1 |
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PFAM |
PF01850
PF10130 PF13470 PF13638 PF10374 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00670
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6ZPY2 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6ZPY2 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3UZS1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 229512 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.439830 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_839977 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Smg5 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38480 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK129286 AK133688 AK155787 BC024683 BC100408 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH24683 AAI00409 BAC98096 BAE21784 BAE33436 | ||||||||||||||||||||||