Mus musculus Protein: Ddx17 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-161890.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ddx17 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 17 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610007K22Rik; A430025E01Rik; AI047725; C80929; Gm926; p72; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000055535 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-161888 (Ddx17) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-dependent ATPase activity. Involved in transcriptional regulation. Transcriptional coactivator for estrogen receptor ESR1. Increases ESR1 AF-1 domain-mediated transactivation (By similarity). Synergizes with DDX5 and SRA1 RNA to activate MYOD1 transcriptional activity and probably involved in skeletal muscle differentiation. Required for zinc-finger antiviral protein ZC3HAV1-mediated mRNA degradation. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:17011493}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Nucleus, nucleolus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 26 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 90 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1914290 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q501J6 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q501J6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q78W10 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67040 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.474608 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_951062 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ddx17 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27643 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC117806 AK027954 AK039888 AK151061 AK152831 AK152910 BC062910 BC096036 CH466550 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH62910 AAH96036 BAC25680 BAC30474 BAE30078 BAE31531 BAE31589 EDL04645 | ||||||||||||||||||||||