Mus musculus Protein: Lgi1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-162950.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lgi1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | leucine-rich repeat LGI family, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BB130740; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000084507 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-162948 (Lgi1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Regulates voltage-gated potassium channels assembled from KCNA1, KCNA4 and KCNAB1. It slows down channel inactivation by precluding channel closure mediated by the KCNAB1 subunit. Ligand for ADAM22 that positively regulates synaptic transmission mediated by AMPA-type glutamate receptors. Plays a role in suppressing the production of MMP1/3 through the phosphatidylinositol 3-kinase/ERK pathway (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted {ECO:0000269PubMed:15857855, ECO:0000269PubMed:16787412}. Cell junction, synapse {ECO:0000250}. Note=Isoform 1 and isoform 2 are detected in the cytosolic and microsomal fractions respectively. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Brain. {ECO:0000269PubMed:16787412}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1861691 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000483
Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype IPR005492 Leucine-rich glioma-inactivated , EPTP repeat IPR009039 EAR IPR017986 WD40-repeat-containing domain |
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PFAM |
PF01463
PF00560 PF13504 PF13855 PF03736 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00082
SM00369 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9JIA1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9JIA1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56839 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.455456 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_064674 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lgi1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29786 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF246818 AK045443 BC066090 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF87077 AAH66090 BAC32370 | ||||||||||||||||||||||