Mus musculus Protein: Thbs4 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-172330.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Thbs4 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | thrombospondin 4 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TSP4; | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000022213 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172328 (Thbs4) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Adhesive glycoprotein that mediates cell-to-cell and cell-to-matrix interactions and is involved in various processes including cellular proliferation, migration, adhesion and attachment, inflammatory response to CNS injury, regulation of vascular inflammation and adaptive responses of the heart to pressure overload and in myocardial function and remodeling. Binds to structural extracellular matrix (ECM) proteins and modulates the ECM in response to tissue damage, contributing to cardioprotective and adaptive ECM remodeling. Plays a role in ER stress response, via its interaction with the activating transcription factor 6 alpha (ATF6) which produces adaptive ER stress response factors and protects myocardium from pressure overload. May contribute to spinal presynaptic hypersensitivity and neuropathic pain states after peripheral nerve injury. May play a role in regulating protective astrogenesis from the subventricular zone (SVZ) niche after injury in a NOTCH1-dependent manner. {ECO:0000269PubMed:20884877, ECO:0000269PubMed:22034490, ECO:0000269PubMed:22362893, ECO:0000269PubMed:22682248, ECO:0000269PubMed:22745497, ECO:0000269PubMed:23615612}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endoplasmic reticulum. Sarcoplasmic reticulum. Secreted. Secreted, extracellular space. Secreted, extracellular space, extracellular matrix. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Heart. Up-regulated in the heart in response to ischemic injury and pathology (at protein level). Astrocytes; expressed at high levels in subventricular zone (SVZ)-derived astrocytes and at low levels in cortical astrocytes. In response to peripheral nerve injury, significantly up-regulated in the dorsal spinal cord (at protein level). {ECO:0000269PubMed:22362893, ECO:0000269PubMed:22745497, ECO:0000269PubMed:23615612}. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1101779 | ||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000742
Epidermal growth factor-like domain IPR001791 Laminin G domain IPR001881 EGF-like calcium-binding domain IPR003367 Thrombospondin, type 3-like repeat IPR008859 Thrombospondin, C-terminal IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily IPR024665 Thrombospondin/cartilage oligomeric matrix protein, coiled-coil domain IPR028974 TSP type-3 repeat |
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PFAM |
PF00008
PF00054 PF02210 PF07645 PF02412 PF05735 PF11598 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00181
SM00210 SM00282 SM00179 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Z1T2 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B2RTL6 | ||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21828 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.20865 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035712 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Thbs4 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26684 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF102887 AF130461 AH007739 BC139414 CH466567 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC73003 AAD27642 AAD32714 AAI39415 EDL00951 | ||||||||||||||||||||||||||