Mus musculus Protein: Ttc21b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-175097.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ttc21b | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | tetratricopeptide repeat domain 21B | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410066K11Rik; aln; mKIAA1992; Thm1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000099779 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-175095 (Ttc21b) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Component of the IFT complex A (IFT-A), a complex required for retrograde ciliary transport. Negatively modulates the SHH signal transduction. {ECO:0000269PubMed:18327258}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme {ECO:0000269PubMed:18327258}. Note=In polarized epithelial inner medullary collecting ducts cells and in the nodes of mice at 8.0 dpc, colocalizes with alpha-tubulin in cilia. Expressed in a punctate manner throughout the axoneme from the cilia base to the tip. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1920918 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001440
Tetratricopeptide TPR1 IPR013026 Tetratricopeptide repeat-containing domain IPR019734 Tetratricopeptide repeat |
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PFAM |
PF00515
PF13174 PF13176 PF13181 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00028
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q0HA38 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q0HA38 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 73668 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.411332 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001041069 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ttc21b | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16076 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK132240 AK173320 AL844526 AL928586 DQ011164 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAY79164 BAD32598 BAE21052 CAM17348 CAM21880 | ||||||||||||||||||||||