Mus musculus Protein: Lta | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-177401.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | lymphotoxin A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | hlb382; LT; LT-[a]; LT-alpha; LT[a]; LTalpha; Ltx; TNF-beta; Tnfb; TNFSF1; Tnfsf1b; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000025266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-177399 (Lta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure |
![]() |
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UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Cytokine that in its homotrimeric form binds to TNFRSF1A/TNFR1, TNFRSF1B/TNFBR and TNFRSF14/HVEM. In its heterotrimeric form with LTB binds to TNFRSF3/LTBR. Lymphotoxin is produced by lymphocytes and cytotoxic for a wide range of tumor cells in vitro and in vivo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted {ECO:0000250}. Membrane {ECO:0000250}. Note=The homotrimer is secreted. The heterotrimer is membrane-associated. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:104797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002960
Lymphotoxin-alpha IPR006052 Tumour necrosis factor domain IPR006053 Tumour necrosis factor IPR008983 Tumour necrosis factor-like domain |
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PFAM |
PF00229
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PRINTS |
PR01236
PR01234 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00207
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P09225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q542S2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.418612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_034865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF109719 AK080308 AK153694 BC099464 M16819 M17015 M60586 U06950 X06217 X06218 X14800 Y00137 Y00467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA18593 AAA39450 AAA40460 AAA40461 AAC82485 AAH99464 BAC37874 BAE32147 CAA29566 CAA29567 CAA32906 CAA68330 CAA68529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||