Mus musculus Protein: Pou5f1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-178410.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pou5f1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | POU domain, class 5, transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NF-A3; Oct-3; Oct-3/4; Oct-4; Oct3; Oct3/4; Oct4; Otf-3; Otf-4; Otf3; Otf3-rs7; Otf3g; Otf4; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000025271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178408 (Pou5f1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcription factor that binds to the octamer motif (5'-ATTTGCAT-3'). Forms a trimeric complex with SOX2 on DNA and controls the expression of a number of genes involved in embryonic development such as YES1, FGF4, UTF1 and ZFP206. Critical for early embryogenesis and for embryonic stem cell pluripotency. {ECO:0000269PubMed:17496161, ECO:0000269PubMed:17525163}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus {ECO:0000255PROSITE-ProRule:PRU00108, ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00530, ECO:0000269PubMed:17496161, ECO:0000269PubMed:17525163}. Note=Expressed in a diffuse and slightly punctuate pattern. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed the totipotent and pluripotent stem cells of the pregastrulation embryo. Also expressed in primordial germ cells and in the female germ line. Absent from adult tissues. {ECO:0000269PubMed:1690859, ECO:0000269PubMed:1972777}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 370 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:101893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000327
POU-specific IPR001356 Homeobox domain IPR009057 Homeodomain-like IPR010982 Lambda repressor-like, DNA-binding domain IPR013847 POU domain |
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PFAM |
PF00157
PF00046 PF13413 |
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PRINTS |
PR00028
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00352
SM00389 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P20263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P20263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E2JL33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.441730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_038661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3L1P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pou5f1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB375269 AB375272 AB375273 AB375274 AB375277 BC068268 CR974473 M34381 S58422 S58423 S58424 S58425 S58426 X52437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA39844 AAB19896 AAH68268 BAG84134 BAG84135 BAG84136 BAG84137 BAG84138 CAA36682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||