Mus musculus Protein: Abcf1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-179788.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Abcf1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000036881 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179786 (Abcf1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Required for efficient Cap- and IRES-mediated mRNA translation initiation. Not involved in the ribosome biogenesis (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Nucleus envelope {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1351658 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003439
ABC transporter-like IPR003593 AAA+ ATPase domain IPR009068 S15/NS1, RNA-binding IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00005
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00382
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6P542 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6P542 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q99K92 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 224742 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.329022 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_038882 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Abcf1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28713 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC112970 BC004811 BC046965 BC063094 BC068282 CR974451 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH04811 AAH46965 AAH63094 AAH68282 | ||||||||||||||||||||||