Mus musculus Protein: Pou4f1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-185466.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pou4f1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | POU domain, class 4, transcription factor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Brn-3; Brn-3.0; Brn3; Brn3.0; Brn3a; E130119J07Rik; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000060798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-185464 (Pou4f1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Probable transcription factor which may play a role in the regulation of specific gene expression within a subset of neuronal lineages. May play a role in determining or maintaining the identities of a small subset of visual system neurons. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Brain, peripheral sensory nervous system and retina. In the adult nervous system BRN-3.0 predominates in the medial habenula, superficial gray of the superior colliculus, red nucleus, mesencephalic nucleus of the trigeminal ganglion, nucleus ambiguus, inferior olivary nucleus, and peripheral sensory ganglia. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:102525 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000327
POU-specific IPR001356 Homeobox domain IPR009057 Homeodomain-like IPR010982 Lambda repressor-like, DNA-binding domain IPR013847 POU domain |
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PFAM |
PF00157
PF00046 PF13413 |
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PRINTS |
PR00028
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00352
SM00389 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P17208 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.474944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pou4f1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC121997 S69350 X51959 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB30577 CAA36218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||