Mus musculus Protein: Cxcr4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-190001.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cxcr4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | chemokine (C-X-C motif) receptor 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | b2b220Clo; CD184; Cmkar4; LESTR; PB-CKR; PBSF/SDF-1; Sdf1r; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000053489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189999 (Cxcr4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Binds bacterial lipopolysaccharide (LPS) et mediates LPS-induced inflammatory response, including TNF secretion by monocytes (By similarity). Receptor for the C-X-C chemokine CXCL12/SDF-1 that transduces a signal by increasing intracellular calcium ion levels and enhancing MAPK1/MAPK3 activation. Acts as a receptor for extracellular ubiquitin; leading to enhanced intracellular calcium ions and reduced cellular cAMP levels. Involved in hematopoiesis and in cardiac ventricular septum formation. Also plays an essential role in vascularization of the gastrointestinal tract, probably by regulating vascular branching and/or remodeling processes in endothelial cells. Involved in cerebellar development. In the CNS, could mediate hippocampal- neuron survival. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:9634237, ECO:0000269PubMed:9634238, ECO:0000269PubMed:9689100}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000250}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000250}. Cell junction {ECO:0000250}. Early endosome {ECO:0000250}. Late endosome {ECO:0000250}. Lysosome {ECO:0000250}. Note=In unstimulated cells, diffuse pattern on plasma membrane. On agonist stimulation, colocalizes with ITCH at the plasma membrane where it becomes ubiquitinated (By similarity). In the presence of antigen, distributes to the immunological synapse forming at the T-cell-APC contact area, where it localizes at the peripheral and distal supramolecular activation cluster (SMAC) (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Lymphocytes, macrophages, neutrophils, microglial cells and astrocytes. Found in spleen, thymus, bone marrow, lymph nodes and, at lower levels in brain, small intestine, stomach and kidney. CXCR4-A is predominant in all tissues tested. During embryonic development, high levels are detected in the endothelium of developing blood vessels and in many regions of the developing brain including the olfactory epithelium, olfactory bulb, hippocampus, cerebellum and spinal cord. {ECO:0000269PubMed:9634237, ECO:0000269PubMed:9634238}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 54 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:109563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000276
G protein-coupled receptor, rhodopsin-like IPR000355 Chemokine receptor family IPR001277 CXC chemokine receptor 4 IPR017452 GPCR, rhodopsin-like, 7TM IPR019424 7TM GPCR, olfactory receptor/chemoreceptor Srsx IPR022726 CXC chemokine receptor 4 N-terminal domain |
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PFAM |
PF00001
PF10320 PF12109 |
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PRINTS |
PR00237
PR00657 PR00645 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P70658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P70658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A1E2I3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_034041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cxcr4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB000803 BC031665 BC098322 D87747 EF101560 U59760 U65580 X99581 X99582 Z80111 Z80112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB07725 AAC52953 AAH31665 AAH98322 ABK96809 BAA13451 BAA19187 CAA67893 CAA67894 CAB02201 CAB02202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||