Mus musculus Gene: Cxcr4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189999.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cxcr4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C-X-C motif) receptor 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | b2b220Clo; CD184; Cmkar4; LESTR; PB-CKR; PBSF/SDF-1; Sdf1r | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000045382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C-X-C motif) receptor 4
chemokine (C-X-C motif) receptor 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Bacterial cell wall glucosaminyl-muramyl dipeptides (GMDPs) bind to the transcription factor Ybx1 to upregulate Nfkb2 and Cxcr4 gene expression.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] CXCR4 is a chemokine receptor that is essential for homing of stem cells and more mature neutrophils to the bone marrow.
[Homo sapiens] MIR146A upregulation by CXCR4 antagonist AMD3100 treatment or ZBTB16 silencing, decreases CXCR4 protein expression and prevents HIV-1 infection of leukemic monocytic cell line and CD4(+) T lymphocytes.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000121966:
This gene encodes a CXC chemokine receptor specific for stromal cell-derived factor-1. The protein has 7 transmembrane regions and is located on the cell surface. It acts with the CD4 protein to support HIV entry into cells and is also highly expressed in breast cancer cells. Mutations in this gene have been associated with WHIM (warts, hypogammaglobulinemia, infections, and myelokathexis) syndrome. Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:128588199-128592293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 54 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GPCR downstream signaling pathway
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Axon guidance pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Endocytosis pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
IL4 pathway
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REACTOME |
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Binding and entry of HIV virion pathway
Early Phase of HIV Life Cycle pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
GPCR ligand binding pathway
Disease pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Signaling by GPCR pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Endocytosis pathway
Chemokine signaling pathway pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
CXCR4-mediated signaling events
S1P3 pathway
HIF-1-alpha transcription factor network
Syndecan-4-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009911 XM_006529113 XM_006529114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||