Mus musculus Protein: Tfip11 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-191100.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tfip11 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | tuftelin interacting protein 11 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2810002G02Rik; AF097181; AW046167; Srr1; TIP33; Tip39; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000031288 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-191098 (Tfip11) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing, specifically in spliceosome disassembly during late-stage splicing events. Intron turnover seems to proceed through reactions in two lariat-intron associated complexes termed Intron Large (IL) and Intron Small (IS). In cooperation with DHX15 seems to mediate the transition of the U2, U5 and U6 snRNP-containing IL complex to the snRNP-free IS complex leading to efficient debranching and turnover of excised introns. May play a role in the differentiation of ameloblasts and odontoblasts or in the forming of the enamel extracellular matrix. {ECO:0000269PubMed:15868102, ECO:0000269PubMed:19857462}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus. Note=In the nucleus localizes to unique speckle domains in close proximity to nuclear speckles and not identical to paraspeckles. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. In tooth it is expressed in ameloblasts and odontoblasts. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1930075 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000467
G-patch domain IPR022159 Tuftelin interacting protein, N-terminal domain IPR022783 GC-rich sequence DNA-binding factor domain |
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PFAM |
PF01585
PF12457 PF07842 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00443
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9ERA6 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9ERA6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TTV6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54723 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.172947 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_061253 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tfip11 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19539 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC123848 AF290474 AK148260 AK161154 AK164414 BC017682 CH466529 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG10198 AAH17682 BAE28444 BAE36218 BAE37777 EDL19976 | ||||||||||||||||||||||