Mus musculus Protein: Clcn6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-204013.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Clcn6 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | chloride channel 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI850629; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000030879 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204011 (Clcn6) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Chloride transport protein, initially identified as voltage-gated chloride channel. The presence of the conserved gating glutamate residues suggests that is functions as antiporter. {ECO:0000269PubMed:16950870}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endosome membrane {ECO:0000269PubMed:16950870}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000269PubMed:16950870}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in whole brain and in hippocampus neurons (at protein level). Detected in brain, trigeminus, dorsal root ganglion, spinal cord, eye, kidney, testis, skeletal muscle, thymus and pancreas. Isoform ClC-6c is expressed only in kidney. {ECO:0000269PubMed:16950870, ECO:0000269PubMed:9224655}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1347049 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000644
CBS domain IPR001807 Chloride channel, voltage gated IPR002248 Chloride channel ClC-6 IPR014743 Chloride channel, core |
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PFAM |
PF00571
PF00654 |
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PRINTS |
PR00762
PR01117 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00116
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O35454 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O35454 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8CJB1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 26372 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.89987 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_036059 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Clcn6 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18928 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF030101 AF030102 AF030103 AF030104 AF030105 AF030106 AF398931 AK145053 AY046557 CH466594 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC17702 AAL17643 AAN40866 BAE26207 EDL14793 | ||||||||||||||||||||||