Mus musculus Gene: Clcn6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204011.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Clcn6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chloride channel 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI850629 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029016 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chloride channel 6
chloride channel 6
chloride channel 6
chloride channel 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000011021:
This gene encodes a member of the voltage-dependent chloride channel protein family. Members of this family can function as either chloride channels or antiporters. This protein is primarily localized to late endosomes and functions as a chloride/proton antiporter. Alternate splicing results in both coding and non-coding variants. Additional alternately spliced variants have been described but their full-length structure is unknown. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:148004259-148038821 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Ion channel transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RHT0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 26372 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.89987 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011929 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18928 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1347049 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Clcn6 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AL606929 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 26372 | ||||||||||||||||||||||