Mus musculus Protein: Trim30a | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-204204.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trim30a | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | tripartite motif-containing 30A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Rpt-1; Rpt1; Trim30; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000076189 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204202 (Trim30a) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Trans-acting factor that regulates gene expression of interleukin 2 receptor alpha chain. May affect IL2R-alpha expression through cis-acting negative regulatory elements or through competition with proteins that bind to enhancer or activator sequences. Negatively regulates Toll-like receptor (TLR)-mediated activation of NFKB by promoting degradation of TAB2 and TAB3 and preventing TRAF6 autoubiquitination. Negatively regulates production of reactive oxygen species (ROS) which inhibits activation of the NLRP3 inflammasome complex. This, in turn, regulates activation of CASP1 and subsequent cleavage of IL1B and IL18. No activity detected against a range of retroviruses including a number of lentiviruses, gammaretroviruses and betaretroviruses. {ECO:0000269PubMed:18345001, ECO:0000269PubMed:19147168, ECO:0000269PubMed:21048113}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in spleen and lymph nodes (at protein level). {ECO:0000269PubMed:18345001}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:98178 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR001870 B30.2/SPRY domain IPR003877 SPla/RYanodine receptor SPRY IPR003879 Butyrophylin-like IPR008985 Concanavalin A-like lectin/glucanases superfamily IPR018355 SPla/RYanodine receptor subgroup IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF00643
PF13639 PF14634 PF00622 PF00097 |
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PRINTS |
PR01407
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00184 SM00449 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P15533 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P15533 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20128 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.413306 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_033125 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 2ECW | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Trim30a | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40068 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC122400 AC142110 AF220014 AF220015 AF220016 AK134144 AK137506 BC005447 CH466531 J03776 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA40073 AAG53468 AAG53469 AAG53470 AAH05447 BAE22032 BAE23387 EDL16725 EDL16726 | ||||||||||||||||||||||