Mus musculus Protein: Siglec1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-206883.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | Siglec1 | ||||||||||||||||||
Protein Name | sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin | ||||||||||||||||||
Synonyms | Cd169; Siglec-1; Sn; | ||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000028794 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-206881 (Siglec1) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Acts as an endocytic receptor mediating clathrin dependent endocytosis. Macrophage-restricted adhesion molecule that mediates sialic-acid dependent binding to lymphocytes, including granulocytes, monocytes, natural killer cells, B-cells and CD8 T-cells (By similarity). Preferentially binds to alpha- 2,3-linked sialic acid. Binds to SPN/CD43 on T-cells. May play a role in hematopoiesis. May act as a counter-receptor for CLEC10A in lymph node. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:15364954}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 1: Cell membrane; Single-pass type I membrane protein.Isoform 2: Secreted.Isoform 3: Secreted. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in lymph node in the subcapsular sinus, interfollicular regions, and T and B-cell boundary (at protein level). Expressed by macrophages in various tissues. Highest expression in spleen and lymph node with lower amounts in lung, liver, bone marrow, heart and skin. No expression in thymus, kidney, brain or small intestine. {ECO:0000269PubMed:15364954}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:99668 | ||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003598
Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin IPR013162 CD80-like, immunoglobulin C2-set |
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PFAM |
PF07679
PF07686 PF00047 PF08205 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00408
SM00409 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q62230 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q62230 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6KAT6 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20612 | ||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1374 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035556 | ||||||||||||||||||
MGI ID | 2BVE | ||||||||||||||||||
MGI Symbol | Siglec1 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16754 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AK131121 AL831736 AL833771 CH466519 U92833 U92834 U92836 U92837 U92838 U92839 U92840 U92841 U92842 Z36233 Z36234 Z36293 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAB95641 BAD21371 CAA85268 CAA85269 CAA85290 EDL28300 | ||||||||||||||||||