Version 5.4
| Mus musculus Gene: Siglec1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-206881.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Siglec1 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin | ||||||||||||||||||
| Synonyms | Cd169; Siglec-1; Sn | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSMUSG00000027322 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin
sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin
sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
| Summary |
Siglec1 is a member of the SIGLEC protein family that recognize sialoside-based patterns and plays a role in the attenuation of innate immunity to avoid autoimmune destruction.
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| InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||
| Summary |
[Homo sapiens] SIGLEC1 is a member of the SIGLEC protein family that recognize sialoside-based patterns and plays a role in the attenuation of innate immunity to avoid autoimmune destruction.
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| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000088827:
This gene encodes a member of the immunoglobulin superfamily. The encoded protein is a lectin-like adhesion molecule that binds glycoconjugate ligands on cell surfaces in a sialic acid-dependent manner. It is a type I transmembrane protein expressed only by a subpopulation of macrophages and is involved in mediating cell-cell interactions. Alternative splicing produces a transcript variant encoding an isoform that is soluble rather than membrane-bound; however, the full-length nature of this variant has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 2:131069220-131086765 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | F1 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME | |||||||||||||||||||
| KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME | |||||||||||||||||||
| KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q62230 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | G3X8X6 Q6KAT6 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 20612 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.1374 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_011426 XM_006499049 XM_006499050 XM_006499051 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS16754 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| MGI ID | MGI:99668 | ||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Siglec1 | ||||||||||||||||||
| EMBL | AK131121 AL831736 AL833771 CH466519 U92833 U92834 U92836 U92837 U92838 U92839 U92840 U92841 U92842 Z36233 Z36234 Z36293 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAB95641 BAD21371 CAA85268 CAA85269 CAA85290 EDL28300 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 20612 | ||||||||||||||||||