Homo sapiens Protein: SON | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-2332.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SON | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | SON DNA binding protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BASS1; C21orf50; DBP-5; NREBP; SON3; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000348984 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2322 (SON) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-binding protein that acts as a mRNA splicing cofactor by promoting efficient splicing of transcripts that possess weak splice sites. Specifically promotes splicing of many cell-cycle and DNA-repair transcripts that possess weak splice sites, such as TUBG1, KATNB1, TUBGCP2, AURKB, PCNT, AKT1, RAD23A, and FANCG. Probably acts by facilitating the interaction between Serine/arginine-rich proteins such as SRSF2 and the RNA polymerase II. Also binds to DNA; binds to the consensus DNA sequence: 5'- GA[GT]AN[CG][AG]CC-3'. May indirectly repress hepatitis B virus (HBV) core promoter activity and transcription of HBV genes and production of HBV virions. {ECO:0000269PubMed:20581448, ECO:0000269PubMed:21504830}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000269PubMed:1424986, ECO:0000269PubMed:21504830}. Note=Colocalizes with the pre-mRNA splicing factor SRSF2. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed, with the higher expression seen in leukocyte and heart. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 73 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000467
G-patch domain IPR014720 Double-stranded RNA-binding domain IPR017986 WD40-repeat-containing domain |
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PFAM |
PF01585
PF00035 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00443
SM00358 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P18583 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P18583 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6651 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.656725 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_620305 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11183 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 182465 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13629 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01678 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB028942 AF139897 AF161428 AF161430 AF380179 AF380180 AF380181 AF380182 AF380183 AF380184 AF435977 AK024752 AP000303 AP000304 AY026895 BC002422 CH471079 M36428 X63071 X63751 X63753 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36624 AAD50078 AAF28988 AAF28990 AAH02422 AAK07692 AAL30810 AAL34497 AAL34498 AAL34499 AAL34500 AAL34501 AAL34502 BAA82971 BAB14985 CAA44793 CAA45282 CAC69885 EAX09814 EAX09818 EAX09821 EAX09823 | ||||||||||||||||||||||