Homo sapiens Protein: IRF7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-235069.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IRF7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | interferon regulatory factor 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IRF-7H; IRF7A; IRF7B; IRF7C; IRF7H; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000380704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-17225 (IRF7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Key transcriptional regulator of type I interferon (IFN)-dependent immune responses and plays a critical role in the innate immune response against DNA and RNA viruses. Regulates the transcription of type I IFN genes (IFN-alpha and IFN-beta) and IFN-stimulated genes (ISG) by binding to an interferon-stimulated response element (ISRE) in their promoters. Can efficiently activate both the IFN-beta (IFNB) and the IFN-alpha (IFNA) genes and mediate their induction via both the virus-activated, MyD88- independent pathway and the TLR-activated, MyD88-dependent pathway. Required during both the early and late phases of the IFN gene induction but is more critical for the late than for the early phase. Exists in an inactive form in the cytoplasm of uninfected cells and following viral infection, double-stranded RNA (dsRNA), or toll-like receptor (TLR) signaling, becomes phosphorylated by IKBKE and TBK1 kinases. This induces a conformational change, leading to its dimerization and nuclear localization where along with other coactivators it can activate transcription of the type I IFN and ISG genes. Can also play a role in regulating adaptive immune responses by inducing PSMB9/LMP2 expression, either directly or through induction of IRF1. Binds to the Q promoter (Qp) of EBV nuclear antigen 1 a (EBNA1) and may play a role in the regulation of EBV latency. Can activate distinct gene expression programs in macrophages and regulate the anti-tumor properties of primary macrophages. {ECO:0000269PubMed:11073981, ECO:0000269PubMed:12374802, ECO:0000269PubMed:15361868, ECO:0000269PubMed:17404045}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm. Note=The phosphorylated and active form accumulates selectively in the nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed predominantly in spleen, thymus and peripheral blood leukocytes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 122 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 16 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001346
Interferon regulatory factor DNA-binding domain IPR008984 SMAD/FHA domain IPR019471 Interferon regulatory factor-3 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00605
PF10401 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00267
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00348
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q92985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PSE3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.166120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7703 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF076494 AK303752 AP006284 BC136555 CH471158 U53830 U53831 U53832 U73036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB17190 AAB80686 AAB80688 AAB80690 AAB80691 AAC70999 AAI36556 BAG64723 EAX02357 EAX02360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||