Homo sapiens Protein: GABARAP | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-23902.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GABARAP | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | GABA(A) receptor-associated protein | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ATG8A; GABARAP-a; MM46; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000306866 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-23900 (GABARAP) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like modifier that plays a role in intracellular transport of GABA(A) receptors and its interaction with the cytoskeleton. Involved in apoptosis. Involved in autophagy. Whereas LC3s are involved in elongation of the phagophore membrane, the GABARAP/GATE-16 subfamily is essential for a later stage in autophagosome maturation. {ECO:0000269PubMed:15977068}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Endomembrane system {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Golgi apparatus membrane {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle, autophagosome {ECO:0000269PubMed:12507496, ECO:0000269PubMed:15169837, ECO:0000269PubMed:17580304, ECO:0000269PubMed:19056683}. Note=Largely associated with intracellular membrane structures including the Golgi apparatus and postsynaptic cisternae. Colocalizes with microtubules (By similarity). Localizes also to discrete punctae along the ciliary axoneme (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Heart, brain, placenta, liver, skeletal muscle, kidney and pancreas. {ECO:0000269PubMed:11146101, ECO:0000269PubMed:9892355}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 69 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004241
Autophagy protein Atg8 ubiquitin like IPR007242 Ubiquitin-like protein Atg12 IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF02991
PF04110 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O95166 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O95166 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6IAW1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 11337 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_009209 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4067 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605125 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11092 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05496 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB030711 AC120057 AF044671 AF067171 AF161586 AF183425 BC106748 BC106749 CH471108 CR457043 CR542235 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD02337 AAD32455 AAD47641 AAG09694 AAI06749 AAI06750 BAB21549 CAG33324 CAG47031 EAW90234 EAW90238 | ||||||||||||||||||||||||||||||