Homo sapiens Protein: SIAH1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-240998.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SIAH1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | seven in absentia homolog 1 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SIAH1A; | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000378214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30112 (SIAH1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase that mediates ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. E3 ubiquitin ligases accept ubiquitin from an E2 ubiquitin- conjugating enzyme in the form of a thioester and then directly transfers the ubiquitin to targeted substrates. Mediates E3 ubiquitin ligase activity either through direct binding to substrates or by functioning as the essential RING domain subunit of larger E3 complexes. Triggers the ubiquitin-mediated degradation of many substrates, including proteins involved in transcription regulation (ELL2, MYB, POU2AF1, PML and RBBP8), a cell surface receptor (DCC), the cell-surface receptor-type tyrosine kinase FLT3, the cytoplasmic signal transduction molecules (KLF10/TIEG1 and NUMB), an antiapoptotic protein (BAG1), a microtubule motor protein (KIF22), a protein involved in synaptic vesicle function in neurons (SYP), a structural protein (CTNNB1) and SNCAIP. Confers constitutive instability to HIPK2 through proteasomal degradation. It is thereby involved in many cellular processes such as apoptosis, tumor suppression, cell cycle, axon guidance, transcription regulation, spermatogenesis and TNF-alpha signaling. Has some overlapping function with SIAH2. Induces apoptosis in cooperation with PEG3. Upon nitric oxid (NO) generation that follows apoptotic stimulation, interacts with S- nitrosylated GAPDH, mediating the translocation of GAPDH to the nucleus. GAPDH acts as a stabilizer of SIAH1, facilitating the degradation of nuclear proteins. {ECO:0000269PubMed:10747903, ECO:0000269PubMed:11146551, ECO:0000269PubMed:11389839, ECO:0000269PubMed:11389840, ECO:0000269PubMed:11483517, ECO:0000269PubMed:11483518, ECO:0000269PubMed:11752454, ECO:0000269PubMed:12072443, ECO:0000269PubMed:14506261, ECO:0000269PubMed:14645235, ECO:0000269PubMed:14654780, ECO:0000269PubMed:15064394, ECO:0000269PubMed:16085652, ECO:0000269PubMed:18536714, ECO:0000269PubMed:19224863, ECO:0000269PubMed:20508617, ECO:0000269PubMed:22483617, ECO:0000269PubMed:9334332, ECO:0000269PubMed:9858595}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus. Note=Predominantly cytoplasmic. Partially nuclear. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed at a low level. Down- regulated in advanced hepatocellular carcinomas. {ECO:0000269PubMed:12557228, ECO:0000269PubMed:9403064}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 125 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001841
Zinc finger, RING-type IPR008974 TRAF-like IPR013010 Zinc finger, SIAH-type IPR018121 Seven-in-absentia protein, TRAF-like domain |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF03145 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00184
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8IUQ4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8IUQ4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BU09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.743277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC023818 AC026470 AJ400626 BC035562 BC042550 BC044920 BX647064 EF026094 U63295 U76247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC12950 AAC51907 AAH35562 AAH42550 AAH44920 ABK15529 CAC35542 CAE46191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||