Mus musculus Protein: Dnmt3b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-261664.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dnmt3b | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DNA methyltransferase 3B | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | MmuIIIB; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000105395 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-210140 (Dnmt3b) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Required for genome-wide de novo methylation and is essential for the establishment of DNA methylation patterns during development. DNA methylation is coordinated with methylation of histones. May preferentially methylates nucleosomal DNA within the nucleosome core region. May function as transcriptional co- repressor by associating with CBX4 and independently of DNA methylation. Seems to be involved in gene silencing. In association with DNMT1 and via the recruitment of CTCFL/BORIS, involved in activation of BAG1 gene expression by modulating dimethylation of promoter histone H3 at H3K4 and H3K9. Function as transcriptional corepressor by associating with ZHX1 (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:15456878}. Note=Accumulates in the major satellite repeats at pericentric heterochromatin. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 74 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1261819 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000313
PWWP domain IPR001525 C-5 cytosine methyltransferase IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR029063 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase-like |
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PFAM |
PF00855
PF00145 |
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PRINTS |
PR00105
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00293
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O88509 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O88509 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13436 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.89772 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001258674 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 1KHC | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Dnmt3b | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16913 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF068626 AF068627 AF068628 AF151969 AF151970 AF151971 AF151972 AF151973 AF151974 AF151975 AF151976 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC40178 AAC40179 AAC40180 AAF74515 AAF74516 AAF74517 AAF74518 AAF74519 AAF74520 AAF74521 AAF74522 | ||||||||||||||||||||||