Version 5.4
| Mus musculus Protein: Rad23a | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-261700.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Rad23a | ||||||||||||||||||||||
| Protein Name | RAD23a homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | 2310040P19Rik; AL024030; HR23A; mHR23A; | ||||||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000105383 | ||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-174863 (Rad23a) | ||||||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
| Function | Multiubiquitin chain receptor involved in modulation of proteasomal degradation. Binds to 'Lys-48'-linked polyubiquitin chains in a length-dependent manner and with a lower affinity to 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains. Proposed to be capable to bind simultaneously to the 26S proteasome and to polyubiquitinated substrates and to deliver ubiquitinated proteins to the proteasome (By similarity). {ECO:0000250}.Involved in nucleotide excision repair and is thought to be functional equivalent for Rad23b in global genome nucleotide excision repair (GG-NER) by association with Xpc. In vitro, the XPC:RAD23A dimer has NER activity. Can stabilize Xpc. Reported differences to Rad23b in regard to NER activity and Xpc stabilization are probably due to differences in expression levels with Rad23a being much less expressed than Rad23b. {ECO:0000269PubMed:12815074, ECO:0000269PubMed:15336624}. | ||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 111 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:105126 | ||||||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR000449
Ubiquitin-associated domain/translation elongation factor EF-Ts, N-terminal IPR000626 Ubiquitin-like IPR004806 UV excision repair protein Rad23 IPR006636 Heat shock chaperonin-binding IPR009060 UBA-like IPR015360 XPC-binding domain IPR015940 Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote IPR022617 Rad60/SUMO-like domain IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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| PFAM |
PF00627
PF00240 PF14560 PF09280 PF11976 |
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| PRINTS |
PR01839
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| PIRSF | |||||||||||||||||||||||
| SMART |
SM00213
SM00727 SM00165 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | P54726 | ||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-P54726 | ||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 19358 | ||||||||||||||||||||||
| UniGene | |||||||||||||||||||||||
| RefSeq | XP_006530837 | ||||||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Rad23a | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | |||||||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | BC145372 CH466525 X92410 | ||||||||||||||||||||||
| GenPept | AAI45373 CAA63145 EDL10960 | ||||||||||||||||||||||