Mus musculus Protein: Pkd1l3 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-262801.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pkd1l3 | ||||||||||||||||||
Protein Name | polycystic kidney disease 1 like 3 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000104865 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-191342 (Pkd1l3) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Component of a calcium channel. May act as a sour taste receptor by forming a calcium channel with PKD1L3 in gustatory cells; however, its contribution to sour taste perception is unclear in vivo and may be indirect. {ECO:0000269PubMed:16805797, ECO:0000269PubMed:16891422, ECO:0000269PubMed:16929298, ECO:0000269PubMed:21098668, ECO:0000269PubMed:21625513}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:16891422, ECO:0000269PubMed:21185261}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000269PubMed:16891422, ECO:0000269PubMed:21185261}. Note=Interaction with PKD2L1 is required for localization to the cell membrane. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in a subset of taste receptor cells distinct from those involved in bitter, sweet and umami taste. Expressed in circumvallate and foliate taste buds, but not in surrounding non-gustatory lingual epithelium cells. Expressed in testis. {ECO:0000269PubMed:16805797, ECO:0000269PubMed:16891422, ECO:0000269PubMed:16929298}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2664670 | ||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000203
GPS motif IPR000434 Polycystic kidney disease type 1 protein IPR001024 PLAT/LH2 domain IPR003915 Polycystic kidney disease type 2 protein IPR005821 Ion transport domain IPR008976 Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2 IPR013122 Polycystin cation channel, PKD1/PKD2 IPR016187 C-type lectin fold |
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PFAM |
PF01825
PF01477 PF00520 PF08016 |
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PRINTS |
PR00500
PR01433 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00303
SM00308 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q2EG98 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q2EG98 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 244646 | ||||||||||||||||||
UniGene | Mm.436810 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001034789 | ||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||
MGI Symbol | Pkd1l3 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40472 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC125162 AY164486 DQ382344 DQ382345 DQ382346 DQ382347 DQ382348 DQ382349 DQ382350 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAO32799 ABD36562 ABD36563 ABD36564 ABD36565 ABD36566 ABD36567 ABD36568 | ||||||||||||||||||