Mus musculus Protein: Nr1h2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-265669.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nr1h2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | nuclear receptor subfamily 1, group H, member 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI194859; LXR; LXRB; LXRbeta; NER1; OR-1; RIP15; Unr; Unr2; UR; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000103545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179265 (Nr1h2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Nuclear receptor. Binds preferentially to double- stranded oligonucleotide direct repeats having the consensus half- site sequence 5'-AGGTCA-3' and 4-nt spacing (DR-4). Regulates cholesterol uptake through MYLIP-dependent ubiquitination of LDLR, VLDLR and LRP8; DLDLR and LRP8. Interplays functionally with RORA for the regulation of genes involved in liver metabolism. {ECO:0000269PubMed:18055760, ECO:0000269PubMed:19520913, ECO:0000269PubMed:20427281}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00407}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 53 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1352463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000536
Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core IPR001628 Zinc finger, nuclear hormone receptor-type IPR001723 Steroid hormone receptor IPR001728 Thyroid hormone receptor IPR003069 Ecdysteroid receptor IPR008946 Nuclear hormone receptor, ligand-binding IPR023257 Liver X receptor |
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PFAM |
PF00104
PF00105 |
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PRINTS |
PR00047
PR00398 PR00546 PR01283 PR02034 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00430
SM00399 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q60644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22260 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Nr1h2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ132602 BC066025 U09419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC52164 AAH66025 CAB51924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||