Mus musculus Protein: Adar | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-266737.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Adar | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | adenosine deaminase, RNA-specific | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Adar1; Adar1p110; Adar1p150; AV242451; mZaADAR; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000103028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-164791 (Adar) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Catalyzes the hydrolytic deamination of adenosine to inosine in double-stranded RNA (dsRNA) referred to as A-to-I RNA editing. This may affect gene expression and function in a number of ways that include mRNA translation by changing codons and hence the amino acid sequence of proteins; pre-mRNA splicing by altering splice site recognition sequences; RNA stability by changing sequences involved in nuclease recognition; genetic stability in the case of RNA virus genomes by changing sequences during viral RNA replication; and RNA structure-dependent activities such as microRNA production or targeting or protein-RNA interactions. Can edit both viral and cellular RNAs and can edit RNAs at multiple sites (hyper-editing) or at specific sites (site-specific editing). Its cellular RNA substrates include: bladder cancer- associated protein (BLCAP), neurotransmitter receptors for glutamate (GRIA2) and serotonin (HTR2C) and GABA receptor (GABRA3). Site-specific RNA editing of transcripts encoding these proteins results in amino acid substitutions which consequently alters their functional activities. Exhibits low-level editing at the GRIA2 Q/R site, but edits efficiently at the R/G site and HOTSPOT1. Does not affect polyomavirus replication but provides protection against virus-induced cytopathic effects. Essential for embryonic development and cell survival and plays a critical role in the maintenance of hematopoietic stem cells. {ECO:0000269PubMed:15556947, ECO:0000269PubMed:17079286, ECO:0000269PubMed:17369310}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 1: Cytoplasm. Nucleus, nucleolus. Note=Long forms starting at Met-1 are found predominantly in cytoplasm. Shuttles between the cytoplasm and nucleus.Isoform 2: Cytoplasm. Nucleus, nucleolus. Note=Long forms starting at Met-1 are found predominantly in cytoplasm.Isoform 3: Nucleus, nucleolus. Note=Short forms starting at Met-519 are found exclusively in the nucleolus.Isoform 4: Nucleus, nucleolus. Note=Short forms starting at Met-519 are found exclusively in the nucleolus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highest levels in brain and spleen. Lowest levels in liver. {ECO:0000269PubMed:12954622}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1889575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000607
Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase (DRADA) IPR002466 Adenosine deaminase/editase IPR014720 Double-stranded RNA-binding domain |
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PFAM |
PF02295
PF02137 PF00035 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00550
SM00552 SM00358 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q99MU3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q99MU3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5J4D5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.316628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001139768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Adar | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS50963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF052506 AF291050 AF291875 AF291876 AF291877 AK089451 AY508955 AY508958 AY509125 AY509126 BC042505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC06233 AAH42505 AAK16101 AAK16102 AAK16103 AAK17103 AAS82588 AAS82589 AAS82590 AAS82591 BAC40888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||