Mus musculus Protein: Tnc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-266802.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | tenascin C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI528729; C130033P17Rik; cytotactin; Hxb; Ten; tenascin-C; TN; TN-C; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000102995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155840 (Tnc) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Extracellular matrix protein implicated in guidance of migrating neurons as well as axons during development, synaptic plasticity as well as neuronal regeneration. Promotes neurite outgrowth when provided to neurons in culture. May play a role in supporting the growth of epithelial tumors. Ligand for integrins alpha-8/beta-1, alpha-9/beta-1, alpha-V/beta-3 and alpha-V/beta-6. {ECO:0000250UniProtKB:P24821, ECO:0000269PubMed:16553788}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | High levels of isoform 2 in lung and brain of newborn mice. High levels of isoform 5 in thymus, moderate levels in brain of newborn and adult mice. Low level of isoform 2 in adult brain. {ECO:0000269PubMed:1717349}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:101922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000742
Epidermal growth factor-like domain IPR002181 Fibrinogen, alpha/beta/gamma chain, C-terminal globular domain IPR003961 Fibronectin, type III IPR013111 EGF-like domain, extracellular |
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PFAM |
PF00008
PF00147 PF00041 PF01108 PF07974 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00181
SM00186 SM00060 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80YX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q80YX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9WUU4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006537837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ236880 AK040167 AL732556 D90343 X56304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAA14355 BAC30529 CAA39751 CAB44238 CAD83047 CAD83048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||