Mus musculus Protein: Arid1a | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-269895.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Arid1a | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | AT rich interactive domain 1A (SWI-like) | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110030E03Rik; BAF250a; Osa1; Smarcf1; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000101517 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-195347 (Arid1a) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Involved in transcriptional activation and repression of select genes by chromatin remodeling (alteration of DNA-nucleosome topology). Binds DNA non-specifically. Also involved in vitamin D- coupled transcription regulation via its association with the WINAC complex, a chromatin-remodeling complex recruited by vitamin D receptor (VDR), which is required for the ligand-bound VDR- mediated transrepression of the CYP27B1 gene (By similarity). Belongs to the neural progenitors-specific chromatin remodeling complex (npBAF complex) and the neuron-specific chromatin remodeling complex (nBAF complex). During neural development a switch from a stem/progenitor to a post-mitotic chromatin remodeling mechanism occurs as neurons exit the cell cycle and become committed to their adult state. The transition from proliferating neural stem/progenitor cells to post-mitotic neurons requires a switch in subunit composition of the npBAF and nBAF complexes. As neural progenitors exit mitosis and differentiate into neurons, npBAF complexes which contain ACTL6A/BAF53A and PHF10/BAF45A, are exchanged for homologous alternative ACTL6B/BAF53B and DPF1/BAF45B or DPF3/BAF45C subunits in neuron- specific complexes (nBAF). The npBAF complex is essential for the self-renewal/proliferative capacity of the multipotent neural stem cells. The nBAF complex along with CREST plays a role regulating the activity of genes essential for dendrite growth. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:17640523}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00355}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. Expressed at high levels in the testis. {ECO:0000269PubMed:11318604}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 30 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 43 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1935147 | ||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001606
ARID/BRIGHT DNA-binding domain IPR016024 Armadillo-type fold IPR021906 Protein of unknown function DUF3518 |
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PFAM |
PF01388
PF12031 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00501
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | A2BH40 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-A2BH40 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8R024 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 93760 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.473166 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001074288 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Arid1a | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38908 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF268912 AK048464 BC028548 BC082554 BX537327 CR751606 CR925752 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH28548 AAH82554 AAK54504 BAC33346 CAM20580 CAM25151 CAM27607 | ||||||||||||||||||||||||||||