Homo sapiens Protein: DDX17 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-293576.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX17 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 17 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | P72; RH70; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000385536 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-7557 (DDX17) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-dependent ATPase activity. Involved in transcriptional regulation. Transcriptional coactivator for estrogen receptor ESR1. Increases ESR1 AF-1 domain-mediated transactivation. Synergizes with DDX5 and SRA1 RNA to activate MYOD1 transcriptional activity and probably involved in skeletal muscle differentiation. Required for zinc-finger antiviral protein ZC3HAV1-mediated mRNA degradation. {ECO:0000269PubMed:11250900, ECO:0000269PubMed:15298701, ECO:0000269PubMed:17011493, ECO:0000269PubMed:17226766, ECO:0000269PubMed:18334637, ECO:0000269PubMed:19718048}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:22002106}. Nucleus, nucleolus {ECO:0000269PubMed:22002106}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 166 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92841 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q92841 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G5E9L5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10521 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.743341 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_006377 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2740 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 608469 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33646 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10532 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL713763 BC000595 CH471095 CR456432 U59321 Z97056 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC50787 AAH00595 CAB09792 CAG30318 CAH10627 CAQ08924 EAW60241 EAW60243 | ||||||||||||||||||||||