Homo sapiens Protein: PRPF40A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-294012.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF40A | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000386458 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-72518 (PRPF40A) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Binds to WASL/N-WASP and suppresses its translocation from the nucleus to the cytoplasm, thereby inhibiting its cytoplasmic function (By similarity). Plays a role in the regulation of cell morphology and cytoskeletal organization. Required in the control of cell shape and migration. May play a role in cytokinesis. May be involved in pre-mRNA splicing. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:21834987}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. Nucleus matrix {ECO:0000269PubMed:16391387}. Note=Colocalizes with AKAP8L in the nuclear matrix. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in the brain cortex (at protein level). Widely expressed. {ECO:0000269PubMed:16391387, ECO:0000269PubMed:9700202}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 209 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000104
Antifreeze protein, type I IPR001202 WW domain IPR002713 FF domain |
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PFAM |
PF00397
PF01846 |
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PRINTS |
PR00308
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00456
SM00441 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O75400 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O75400 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q4ZG51 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55660 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.714901 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_060362 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16463 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 612941 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS46430 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC012443 AC079344 AF049523 AF049524 AF049528 AF151059 AF155096 AK000592 AK024810 AK315187 BC011788 BC027178 U70667 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB93495 AAC27501 AAC27502 AAC27506 AAD42862 AAF36145 AAH11788 AAH27178 AAX88960 BAA91277 BAB15016 BAG37627 | ||||||||||||||||||||||