Homo sapiens Protein: DDX23 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-30455.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX23 | ||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23 | ||||||||||||||||||
Synonyms | prp28; PRPF28; SNRNP100; U5-100K; U5-100KD; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000310723 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30453 (DDX23) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing and its phosphorylated form (by SRPK2) is required for spliceosomal B complex formation. {ECO:0000269PubMed:18425142}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:20858735, ECO:0000269PubMed:9409622}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 39 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9BUQ8 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9BUQ8 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | F8W1J5 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9416 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.130098 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004809 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17347 | ||||||||||||||||||
OMIM | 612172 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8770 | ||||||||||||||||||
HPRD | 09908 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC117498 AF026402 AK128428 AK312379 BC002366 CH471111 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAB87902 AAH02366 BAG35297 BAG54673 EAW58011 EAW58015 | ||||||||||||||||||