Homo sapiens Protein: RB1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-32094.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | retinoblastoma 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | OSRC; p105-Rb; pp110; PPP1R130; pRb; RB; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000267163 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32092 (RB1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Key regulator of entry into cell division that acts as a tumor suppressor. Promotes G0-G1 transition when phosphorylated by CDK3/cyclin-C. Acts as a transcription repressor of E2F1 target genes. The underphosphorylated, active form of RB1 interacts with E2F1 and represses its transcription activity, leading to cell cycle arrest. Directly involved in heterochromatin formation by maintaining overall chromatin structure and, in particular, that of constitutive heterochromatin by stabilizing histone methylation. Recruits and targets histone methyltransferases SUV39H1, SUV420H1 and SUV420H2, leading to epigenetic transcriptional repression. Controls histone H4 'Lys-20' trimethylation. Inhibits the intrinsic kinase activity of TAF1. Mediates transcriptional repression by SMARCA4/BRG1 by recruiting a histone deacetylase (HDAC) complex to the c-FOS promoter. In resting neurons, transcription of the c-FOS promoter is inhibited by BRG1-dependent recruitment of a phospho-RB1-HDAC1 repressor complex. Upon calcium influx, RB1 is dephosphorylated by calcineurin, which leads to release of the repressor complex (By similarity). In case of viral infections, interactions with SV40 large T antigen, HPV E7 protein or adenovirus E1A protein induce the disassembly of RB1-E2F1 complex thereby disrupting RB1's activity. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:15084261}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:20940255}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Childhood cancer retinoblastoma (RB) [MIM:180200]: Congenital malignant tumor that arises from the nuclear layers of the retina. It occurs in about 1:20'000 live births and represents about 2% of childhood malignancies. It is bilateral in about 30% of cases. Although most RB appear sporadically, about 20% are transmitted as an autosomal dominant trait with incomplete penetrance. The diagnosis is usually made before the age of 2 years when strabismus or a gray to yellow reflex from pupil ('cat eye') is investigated. {ECO:0000269PubMed:10671068, ECO:0000269PubMed:11524739, ECO:0000269PubMed:1352883, ECO:0000269PubMed:2594029, ECO:0000269PubMed:7704558, ECO:0000269PubMed:7795591, ECO:0000269PubMed:7927327, ECO:0000269PubMed:8346255, ECO:0000269PubMed:8605116, ECO:0000269PubMed:8776589, ECO:0000269PubMed:9140452, ECO:0000269PubMed:9311732, ECO:0000269PubMed:9973307}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Bladder cancer (BLC) [MIM:109800]: A malignancy originating in tissues of the urinary bladder. It often presents with multiple tumors appearing at different times and at different sites in the bladder. Most bladder cancers are transitional cell carcinomas that begin in cells that normally make up the inner lining of the bladder. Other types of bladder cancer include squamous cell carcinoma (cancer that begins in thin, flat cells) and adenocarcinoma (cancer that begins in cells that make and release mucus and other fluids). Bladder cancer is a complex disorder with both genetic and environmental influences. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry.Osteogenic sarcoma (OSRC) [MIM:259500]: A sarcoma originating in bone-forming cells, affecting the ends of long bones. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in the retina. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 479 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 38 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002719
Retinoblastoma-associated protein, B-box IPR002720 Retinoblastoma-associated protein, A-box IPR013763 Cyclin-like IPR015030 Retinoblastoma-associated protein, C-terminal IPR024599 Retinoblastoma-associated protein, N-terminal |
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PFAM |
PF01857
PF01858 PF08934 PF11934 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00385
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P06400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P06400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | V9H020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.605217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 614041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF551763 AK291258 AK299179 AL136960 AL392048 AY643840 BC039060 BC040540 CH471075 L11910 L35146 L35147 L41870 L41889 L41890 L41891 L41893 L41894 L41895 L41896 L41897 L41898 L41899 L41904 L41905 L41908 L41909 L41910 L41912 L41914 L41924 L41997 L49225 L49231 L49232 M15400 M27845 M27846 M27847 M27849 M27850 M27851 M27852 M27853 M27854 M27855 M27856 M27857 M27858 M27859 M27860 M27862 M27863 M27864 M27865 M27866 M28419 M33647 X16439 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA53483 AAA53484 AAA65735 AAA65736 AAA65737 AAA65738 AAA65739 AAA65740 AAA65741 AAA65743 AAA65744 AAA65745 AAA65746 AAA65747 AAA65749 AAA69806 AAA69807 AAA69808 AAA82557 AAA82558 AAA82563 AAB59465 AAB59467 AAB59471 AAB59473 AAB59479 AAB59482 AAB59580 AAH39060 AAH40540 AAN64133 AAT66036 BAF83947 BAG61225 CAA34462 CAH70901 CAH72243 EAX08793 EAX08794 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||