Homo sapiens Protein: CDH5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-34873.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDH5 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | cadherin 5, type 2 (vascular endothelium) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 7B4; CD144; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000344115 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-34871 (CDH5) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Cadherins are calcium-dependent cell adhesion proteins. They preferentially interact with themselves in a homophilic manner in connecting cells; cadherins may thus contribute to the sorting of heterogeneous cell types. This cadherin may play a important role in endothelial cell biology through control of the cohesion and organization of the intercellular junctions. It associates with alpha-catenin forming a link to the cytoskeleton. Acts in concert with KRIT1 to establish and maintain correct endothelial cell polarity and vascular lumen. These effects are mediated by recruitment and activation of the Par polarity complex and RAP1B. Required for activation of PRKCZ and for the localization of phosphorylated PRKCZ, PARD3, TIAM1 and RAP1B to the cell junction. {ECO:0000269PubMed:20332120, ECO:0000269PubMed:21269602}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell junction {ECO:0000269PubMed:20332120}. Cell membrane {ECO:0000305PubMed:20332120}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000305PubMed:20332120}. Note=Found at cell-cell boundaries and probably at cell-matrix boundaries. KRIT1 and CDH5 reciprocally regulate their localization to endothelial cell-cell junctions. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Endothelial tissues and brain. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000233
Cadherin, cytoplasmic domain IPR002126 Cadherin IPR015919 Cadherin-like |
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PFAM |
PF01049
PF00028 |
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PRINTS |
PR00205
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00112
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P33151 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P33151 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q59EA3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1003 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.76206 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001786 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1764 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601120 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10804 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03075 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB035304 AB209908 AC132186 AK300322 BC096363 BC096364 BC117520 U84722 X59796 X79981 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB41796 AAH96363 AAH96364 AAI17521 BAA87418 BAD93145 BAG62074 CAA42468 CAA56306 | ||||||||||||||||||||||