Homo sapiens Gene: CDH5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-34871.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CDH5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cadherin 5, type 2 (vascular endothelium) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 7B4; CD144 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000179776 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cadherin 5, type 2 (vascular endothelium)
cadherin 5, type 2 (vascular endothelium)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a classical cadherin from the cadherin superfamily and is located in a six-cadherin cluster in a region on the long arm of chromosome 16 that is involved in loss of heterozygosity events in breast and prostate cancer. The encoded protein is a calcium-dependent cell-cell adhesion glycoprotein comprised of five extracellular cadherin repeats, a transmembrane region and a highly conserved cytoplasmic tail. Functioning as a classic cadherin by imparting to cells the ability to adhere in a homophilic manner, the protein may play an important role in endothelial cell biology through control of the cohesion and organization of the intercellular junctions. An alternative splice variant has been described but its full length sequence has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:66366622-66404786 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Adherens junctions interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Signaling by VEGF pathway
VEGFR2 mediated vascular permeability pathway
Signal Transduction pathway
VEGFA-VEGFR2 Pathway pathway
Cell-cell junction organization pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
S1P2 pathway
Signaling events mediated by VEGFR1 and VEGFR2
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1003 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.76206 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001795 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1764 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601120 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10804 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03075 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 1003 | ||||||||||||||||||||||