Homo sapiens Protein: RBM5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-35858.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBM5 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA binding motif protein 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | G15; LUCA15; RMB5; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000343054 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-35856 (RBM5) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Component of the spliceosome A complex. Regulates alternative splicing of a number of mRNAs. May modulate splice site pairing after recruitment of the U1 and U2 snRNPs to the 5' and 3' splice sites of the intron. May both positively and negatively regulate aopotosis by regulating the alternative splicing of several genes involved in this process, including FAS and CASP2/caspase-2. In the case of FAS, promotes exclusion of exon 6 thereby producing a soluble form of FAS that inhibits apoptosis. In the case of CASP2/caspase-2, promotes exclusion of exon 9 thereby producing a catalytically active form of CASP2/Caspase-2 that induces apoptosis. {ECO:0000269PubMed:10949932, ECO:0000269PubMed:12207175, ECO:0000269PubMed:12581154, ECO:0000269PubMed:15192330, ECO:0000269PubMed:16585163, ECO:0000269PubMed:18840686, ECO:0000269PubMed:18851835}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:18851835}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 5 is widely expressed in normal tissues and is expressed at increased levels in T-leukemic cell lines. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000467
G-patch domain IPR000504 RNA recognition motif domain IPR001876 Zinc finger, RanBP2-type IPR007087 Zinc finger, C2H2 |
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PFAM |
PF01585
PF00076 PF00641 PF00096 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00443
SM00360 SM00547 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P52756 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P52756 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JR02 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10181 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.735496 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005769 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9902 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 606884 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2810 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06052 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC104450 AF091263 AF103802 AF107493 AK297249 AK297445 AK302766 AK314032 CH471055 U23946 U73168 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA99715 AAB42216 AAD04159 AAF02422 AAF99551 BAG36742 BAG59728 BAG59871 BAG63975 EAW65040 EAW65041 EAW65042 | ||||||||||||||||||||||