Homo sapiens Protein: PSPC1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-361075.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PSPC1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | paraspeckle component 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000393069 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-12561 (PSPC1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Regulates, cooperatively with NONO and SFPQ, androgen receptor-mediated gene transcription activity in Sertoli cell line (By similarity). Binds to poly(A), poly(G) and poly(U) RNA homopolymers. Regulates the circadian clock by repressing the transcriptional activator activity of the CLOCK-ARNTL/BMAL1 heterodimer (By similarity). Together with NONO, required for the formation of nuclear paraspeckles. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:22416126}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus. Nucleus matrix {ECO:0000250}. Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus speckle. Note=In punctate subnuclear structures often located adjacent to splicing speckles, called paraspeckles. Colocalizes with NONO and SFPQ in paraspeckles and perinucleolar caps in an RNA-dependent manner. May cycles between paraspeckles and nucleolus. In telophase, when daughter nuclei form, localizes to perinucleolar caps. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in pancreas, kidney, skeletal muscle, liver, lung, placenta, brain and heart. {ECO:0000269PubMed:11790299}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR012975 NOPS |
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PFAM |
PF00076
PF08075 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8WXF1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | X6RDA4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55269 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.732043 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20320 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 612408 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | 10172 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL354808 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||