Homo sapiens Gene: PSPC1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-12561.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PSPC1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | paraspeckle component 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000121390 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
paraspeckle component 1
paraspeckle component 1
paraspeckle component 1
paraspeckle component 1
paraspeckle component 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nucleolar protein that localizes to punctate subnuclear structures that occur close to splicing speckles, known as paraspeckles. These paraspeckles are composed of RNA-protein structures that include a non-coding RNA, NEAT1/Men epsilon/beta, and the Drosophila Behavior Human Splicing family of proteins, which include the product of this gene and the P54NRB/NONO and PSF/SFPQ proteins. Paraspeckles may function in the control of gene expression via an RNA nuclear retention mechanism. The protein encoded by this gene is found in paraspeckles in transcriptionally active cells, but it localizes to unique cap structures at the nucleolar periphery when RNA polymerase II transcription is inhibited, or during telophase. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. A related pseudogene, which is also located on chromosome 13, has been identified. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:19674752-19783019 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12.11 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.213198 Hs.610343 Hs.629011 Hs.720915 Hs.732043 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001042414 XM_006719844 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41870 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10172 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||