Version 5.4
| Homo sapiens Protein: KDM4C | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-362825.5 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | KDM4C | ||||||||||||||||||||||
| Protein Name | lysine (K)-specific demethylase 4C | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000400127 | ||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-49006 (KDM4C) | ||||||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
| Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 9' and 'Lys-36' residues of histone H3, thereby playing a central role in histone code. Does not demethylate histone H3 'Lys-4', H3 'Lys-27' nor H4 'Lys-20'. Demethylates trimethylated H3 'Lys-9' and H3 'Lys-36' residue, while it has no activity on mono- and dimethylated residues. Demethylation of Lys residue generates formaldehyde and succinate. {ECO:0000269PubMed:16603238}. | ||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00537}. | ||||||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Overexpressed in several esophageal squamous cell carcinomas (ESCs). {ECO:0000269PubMed:10987278}. | ||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001965
Zinc finger, PHD-type IPR002999 Tudor domain IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type |
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| PFAM |
PF00567
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| PRINTS | |||||||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||||||
| SMART |
SM00249
SM00333 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q9H3R0 | ||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 23081 | ||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.734829 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | |||||||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:17071 | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | 605469 | ||||||||||||||||||||||
| CCDS | |||||||||||||||||||||||
| HPRD | 12016 | ||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||||||