Homo sapiens Protein: RAF1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-364474.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAF1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | v-raf-1 murine leukemia viral oncogene homolog 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | c-Raf; CMD1NN; CRAF; NS5; Raf-1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000401888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-19277 (RAF1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Serine/threonine-protein kinase that acts as a regulatory link between the membrane-associated Ras GTPases and the MAPK/ERK cascade, and this critical regulatory link functions as a switch determining cell fate decisions including proliferation, differentiation, apoptosis, survival and oncogenic transformation. RAF1 activation initiates a mitogen-activated protein kinase (MAPK) cascade that comprises a sequential phosphorylation of the dual-specific MAPK kinases (MAP2K1/MEK1 and MAP2K2/MEK2) and the extracellular signal-regulated kinases (MAPK3/ERK1 and MAPK1/ERK2). The phosphorylated form of RAF1 (on residues Ser-338 and Ser-339, by PAK1) phosphorylates BAD/Bcl2- antagonist of cell death at 'Ser-75'. Phosphorylates adenylyl cyclases: ADCY2, ADCY5 and ADCY6, resulting in their activation. Phosphorylates PPP1R12A resulting in inhibition of the phosphatase activity. Phosphorylates TNNT2/cardiac muscle troponin T. Can promote NF-kB activation and inhibit signal transducers involved in motility (ROCK2), apoptosis (MAP3K5/ASK1 and STK3/MST2), proliferation and angiogenesis (RB1). Can protect cells from apoptosis also by translocating to the mitochondria where it binds BCL2 and displaces BAD/Bcl2-antagonist of cell death. Regulates Rho signaling and migration, and is required for normal wound healing. Plays a role in the oncogenic transformation of epithelial cells via repression of the TJ protein, occludin (OCLN) by inducing the up-regulation of a transcriptional repressor SNAI2/SLUG, which induces down-regulation of OCLN. Restricts caspase activation in response to selected stimuli, notably Fas stimulation, pathogen-mediated macrophage apoptosis, and erythroid differentiation. {ECO:0000269PubMed:11427728, ECO:0000269PubMed:11719507, ECO:0000269PubMed:15385642, ECO:0000269PubMed:15618521, ECO:0000269PubMed:15849194, ECO:0000269PubMed:16892053, ECO:0000269PubMed:16924233, ECO:0000269PubMed:9360956}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Cell membrane. Mitochondrion. Nucleus. Note=Colocalizes with RGS14 and BRAF in both the cytoplasm and membranes. Phosphorylation at Ser-259 impairs its membrane accumulation. Recruited to the cell membrane by the active Ras protein. Phosphorylation at Ser-338 and Ser-339 by PAK1 is required for its mitochondrial localization. Retinoic acid- induced Ser-621 phosphorylated form of RAF1 is predominantly localized at the nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Noonan syndrome 5 (NS5) [MIM:611553]: A form of Noonan syndrome, a disease characterized by short stature, facial dysmorphic features such as hypertelorism, a downward eyeslant and low-set posteriorly rotated ears, and a high incidence of congenital heart defects and hypertrophic cardiomyopathy. Other features can include a short neck with webbing or redundancy of skin, deafness, motor delay, variable intellectual deficits, multiple skeletal defects, cryptorchidism, and bleeding diathesis. Individuals with Noonan syndrome are at risk of juvenile myelomonocytic leukemia, a myeloproliferative disorder characterized by excessive production of myelomonocytic cells. {ECO:0000269PubMed:17603482, ECO:0000269PubMed:17603483, ECO:0000269PubMed:20683980}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.LEOPARD syndrome 2 (LEOPARD2) [MIM:611554]: A disorder characterized by lentigines, electrocardiographic conduction abnormalities, ocular hypertelorism, pulmonic stenosis, abnormalities of genitalia, retardation of growth, and sensorineural deafness. {ECO:0000269PubMed:17603483}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | In skeletal muscle, isoform 1 is more abundant than isoform 2. {ECO:0000269PubMed:1886707}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 252 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR002219 Protein kinase C-like, phorbol ester/diacylglycerol-binding domain IPR002290 Serine/threonine/dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR003116 Raf-like Ras-binding IPR011009 Protein kinase-like domain IPR020454 Diacylglycerol/phorbol-ester binding IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF00069
PF07714 PF00130 PF02196 |
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PRINTS |
PR00109
PR00008 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00109
SM00220 SM00455 SM00219 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P04049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P04049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5894 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.632896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 164760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK312248 AY271661 BC018119 CH471055 EU332868 L00206 L00207 L00208 L00209 L00210 L00211 L00212 L00213 M11376 X03484 X54851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA60247 AAH18119 AAP03432 ABY87557 BAG35180 CAA27204 EAW64134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||