Mus musculus Protein: Cbx5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-400675.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cbx5 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610029O15Rik; C75991; HP1; Hp1a; Hp1alpha; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000113157 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189469 (Cbx5) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Component of heterochromatin that recognizes and binds histone H3 tails methylated at 'Lys-9' (H3K9me), leading to epigenetic repression. In contrast, it is excluded from chromatin when 'Tyr-41' of histone H3 is phosphorylated (H3Y41ph). Can interact with lamin-B receptor (LBR). This interaction can contribute to the association of the heterochromatin with the inner nuclear membrane. Involved in the formation of functional kinetochore through interaction with MIS12 complex proteins (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Chromosome. Chromosome, centromere. Note=Component of centromeric and pericentromeric heterochromatin. Associates with chromosomes during mitosis. Associates specifically with chromatin during metaphase and anaphase. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 38 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 113 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:109372 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000953
Chromo domain/shadow IPR008251 Chromo shadow domain IPR016197 Chromo domain-like IPR017984 Chromo domain subgroup IPR023780 Chromo domain |
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PFAM |
PF01393
PF00385 |
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PRINTS |
PR00504
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00298
SM00300 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q61686 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q61686 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z0U2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12419 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.473646 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001070257 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cbx5 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37231 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC162693 AC164069 AF216290 AK008792 AK018349 AK019198 AK030366 AK030442 AK032975 BC004707 X99641 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF80993 AAH04707 BAB25897 BAB31173 BAB31596 BAC26923 BAC26966 BAC28107 CAA67960 | ||||||||||||||||||||||