Mus musculus Protein: Adar | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-401064.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Adar | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | adenosine deaminase, RNA-specific | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Adar1; Adar1p110; Adar1p150; AV242451; mZaADAR; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000113453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-164791 (Adar) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Catalyzes the hydrolytic deamination of adenosine to inosine in double-stranded RNA (dsRNA) referred to as A-to-I RNA editing. This may affect gene expression and function in a number of ways that include mRNA translation by changing codons and hence the amino acid sequence of proteins; pre-mRNA splicing by altering splice site recognition sequences; RNA stability by changing sequences involved in nuclease recognition; genetic stability in the case of RNA virus genomes by changing sequences during viral RNA replication; and RNA structure-dependent activities such as microRNA production or targeting or protein-RNA interactions. Can edit both viral and cellular RNAs and can edit RNAs at multiple sites (hyper-editing) or at specific sites (site-specific editing). Its cellular RNA substrates include: bladder cancer- associated protein (BLCAP), neurotransmitter receptors for glutamate (GRIA2) and serotonin (HTR2C) and GABA receptor (GABRA3). Site-specific RNA editing of transcripts encoding these proteins results in amino acid substitutions which consequently alters their functional activities. Exhibits low-level editing at the GRIA2 Q/R site, but edits efficiently at the R/G site and HOTSPOT1. Does not affect polyomavirus replication but provides protection against virus-induced cytopathic effects. Essential for embryonic development and cell survival and plays a critical role in the maintenance of hematopoietic stem cells. {ECO:0000269PubMed:15556947, ECO:0000269PubMed:17079286, ECO:0000269PubMed:17369310}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 1: Cytoplasm. Nucleus, nucleolus. Note=Long forms starting at Met-1 are found predominantly in cytoplasm. Shuttles between the cytoplasm and nucleus.Isoform 2: Cytoplasm. Nucleus, nucleolus. Note=Long forms starting at Met-1 are found predominantly in cytoplasm.Isoform 3: Nucleus, nucleolus. Note=Short forms starting at Met-519 are found exclusively in the nucleolus.Isoform 4: Nucleus, nucleolus. Note=Short forms starting at Met-519 are found exclusively in the nucleolus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highest levels in brain and spleen. Lowest levels in liver. {ECO:0000269PubMed:12954622}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1889575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002466
Adenosine deaminase/editase IPR014720 Double-stranded RNA-binding domain |
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PFAM |
PF02137
PF00035 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00552
SM00358 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q99MU3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q99MU3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5J3Q8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.316628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Adar | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF052506 AF291050 AF291875 AF291876 AF291877 AK089451 AY509125 AY509126 BC042505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC06233 AAH42505 AAK16101 AAK16102 AAK16103 AAK17103 AAS82590 AAS82591 BAC40888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||