Homo sapiens Protein: VPS4B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-4399.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VPS4B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | vacuolar protein sorting 4 homolog B (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SKD1; SKD1B; VPS4-2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000238497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4397 (VPS4B) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Involved in late steps of the endosomal multivesicular bodies (MVB) pathway. Recognizes membrane-associated ESCRT-III assemblies and catalyzes their disassembly, possibly in combination with membrane fission. Redistributes the ESCRT-III components to the cytoplasm for further rounds of MVB sorting. MVBs contain intraluminal vesicles (ILVs) that are generated by invagination and scission from the limiting membrane of the endosome and mostly are delivered to lysosomes enabling degradation of membrane proteins, such as stimulated growth factor receptors, lysosomal enzymes and lipids. In conjunction with the ESCRT machinery also appears to function in topologically equivalent membrane fission events, such as the terminal stages of cytokinesis and enveloped virus budding (HIV-1 and other lentiviruses). {ECO:0000269PubMed:11563910, ECO:0000269PubMed:14505570, ECO:0000269PubMed:18687924}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Prevacuolar compartment membrane; Peripheral membrane protein. Late endosome membrane {ECO:0000305}; Peripheral membrane protein {ECO:0000305}. Note=Membrane-associated in the prevacuolar endosomal compartment. Localized in HIV-1 particles purified from acutely infected cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed. {ECO:0000269PubMed:11563910}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 31 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002611
IstB-like ATP-binding protein IPR003593 AAA+ ATPase domain IPR003959 ATPase, AAA-type, core IPR007330 MIT IPR008824 DNA helicase, Holliday junction RuvB type, N-terminal IPR011704 ATPase, dynein-related, AAA domain IPR015415 Vps4 oligomerisation, C-terminal IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF01695
PF00004 PF07724 PF13304 PF04212 PF05496 PF07728 PF09336 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00382
SM00745 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O75351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O75351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R2C5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9525 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.126550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 609983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF038960 AF195514 AF282904 AY232629 BC039574 CH471096 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC39874 AAG01471 AAG33022 AAH39574 AAP59551 EAW63143 EAW63144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||