Homo sapiens Gene: VPS4B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4397.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VPS4B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 4 homolog B (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SKD1; SKD1B; VPS4-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000119541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 4 homolog B (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the AAA protein family (ATPases associated with diverse cellular activities), and is the homolog of the yeast Vps4 protein. In humans, two paralogs of the yeast protein have been identified. The former share a high degree of aa sequence similarity with each other, and also with yeast Vps4 and mouse Skd1 proteins. Mouse Skd1 (suppressor of K+ transport defect 1) has been shown to be a yeast Vps4 ortholog. Functional studies indicate that both human paralogs associate with the endosomal compartments, and are involved in intracellular protein trafficking, similar to Vps4 protein in yeast. The gene encoding this paralog has been mapped to chromosome 18; the gene for the other resides on chromosome 16. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:63389190-63422483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 31 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Budding and maturation of HIV virion pathway
Disease pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.126550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||