Homo sapiens Protein: IRF8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-45280.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IRF8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | interferon regulatory factor 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | H-ICSBP; ICSBP; ICSBP1; IMD32A; IMD32B; IRF-8; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000268638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-45278 (IRF8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Specifically binds to the upstream regulatory region of type I IFN and IFN-inducible MHC class I genes (the interferon consensus sequence (ICS)). Plays a negative regulatory role in cells of the immune system. Involved in CD8(+) dendritic cell differentiation by forming a complex with the BATF-JUNB heterodimer in immune cells, leading to recognition of AICE sequence (5'-TGAnTCA/GAAA-3'), an immune-specific regulatory element, followed by cooperative binding of BATF and IRF8 and activation of genes (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:23166356}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | IRF8 deficiency, autosomal dominant (IRF8DD) [MIM:614893]: An immunologic disorder characterized by abnormal peripheral blood myeloid phenotype with a marked loss of CD11C- positive/CD1C dendritic cells, resulting in selective susceptibility to mycobacterial infections. {ECO:0000269PubMed:21524210}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.IRF8 deficiency, autosomal recessive (IRF8DR) [MIM:614894]: A life-threatening pediatric disease characterized by monocyte and dendritic cell deficiency, myeloproliferation, and susceptibility to severe opportunistic infections, including disseminated BCG infection and oral candidiasis. {ECO:0000269PubMed:21524210}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Predominantly expressed in lymphoid tissues. {ECO:0000269PubMed:1460054, ECO:0000269PubMed:23166356}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 97 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 279 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001346
Interferon regulatory factor DNA-binding domain IPR008984 SMAD/FHA domain IPR019471 Interferon regulatory factor-3 |
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PFAM |
PF00605
PF10401 |
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PRINTS |
PR00267
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00348
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q02556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q02556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BT31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.137427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10956 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC092723 BC126247 M91196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB63813 AAI26248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||