Homo sapiens Gene: IRF8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-45278.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IRF8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon regulatory factor 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | H-ICSBP; ICSBP; ICSBP1; IMD32A; IMD32B; IRF-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000140968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon regulatory factor 8
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
IRF8 interacts with TRAF6 to modulate TLR signalling and may also contribute to the cross-talk between IFN-gamma and TLR signalling pathways.
IRF8 belongs to a family of interferon (IFN) regulatory factors that modulate various important physiologic processes including host defence, cell growth and differentiation and immune regulation.
De-SUMOylation of IRF8 at residue Lys310 acts as a molecular mechanism to trigger innate immune responses in activated macrophages. (Demonstrated in mice)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] De-SUMOylation of IRF8 at residue Lys310 acts as a molecular mechanism to trigger innate immune responses in activated macrophages.
[Mus musculus] Irf8-Ifng circuit is a novel gastric innate immune mechanism in the host defense against infection with Helicobacter pylori.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Interferon consensus sequence-binding protein (ICSBP) is a transcription factor of the interferon (IFN) regulatory factor (IRF) family. Proteins of this family are composed of a conserved DNA-binding domain in the N-terminal region and a divergent C-terminal region that serves as the regulatory domain. The IRF family proteins bind to the IFN-stimulated response element (ISRE) and regulate expression of genes stimulated by type I IFNs, namely IFN-alpha and IFN-beta. IRF family proteins also control expression of IFN-alpha and IFN-beta-regulated genes that are induced by viral infection. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:85898803-85922609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q24.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 97 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 279 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
GMCSF-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q02556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BPS5 H3BQH6 H3BQK3 H3BRT4 H3BT31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.137427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002163 XM_006721187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10956 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC092723 BC126247 M91196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB63813 AAI26248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||