Homo sapiens Protein: SNX6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-4566.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNX6 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | sorting nexin 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000355217 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4564 (SNX6) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | May be involved in several stages of intracellular trafficking. Promotes lysosomal degradation of CDKN1B (By similarity). Plays a role in retrograde protein transport from endosomes to the trans-Golgi network. May function as link between transport vesicles and dynactin. Negatively regulates retrograde transport of BACE1 from the cell surface to the trans-Golgi network. May contribute to transcription regulation. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:19935774, ECO:0000269PubMed:20354142, ECO:0000269PubMed:20830743}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasmic vesicle membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Early endosome membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cytoplasm. Nucleus. Note=Interaction with SNX1 or SNX2 promotes location at endosome membranes. Only a minor proportion is seen in the nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 50 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001683
Phox homologous domain IPR004148 BAR domain IPR014637 Sorting nexin-5/6/32 IPR015404 Vps5 C-terminal |
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PFAM |
PF00787
PF03114 PF09325 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF036924
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SMART |
SM00312
SM00721 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UNH7 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5QTQ6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 58533 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.720717 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_689419 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14970 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 606098 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41942 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 12086 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF109364 AF121856 AK021456 AL445363 AL445883 BC001798 CH471078 U83194 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD24202 AAD27829 AAH01798 AAQ13512 BAG51034 EAW65913 EAW65915 | ||||||||||||||||||||||