Homo sapiens Protein: ZRSR2 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-46937.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | ZRSR2 | ||||||||||||||||||
Protein Name | zinc finger (CCCH type), RNA-binding motif and serine/arginine rich 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | U2AF1-RS2; U2AF1L2; U2AF1RS2; URP; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000303015 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-46935 (ZRSR2) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Pre-mRNA-binding protein required for splicing of both U2- and U12-type introns. Selectively interacts with the 3'-splice site of U2- and U12-type pre-mRNAs and promotes different steps in U2 and U12 intron splicing. Recruited to U12 pre-mRNAs in an ATP- dependent manner and is required for assembly of the prespliceosome, a precursor to other spliceosomal complexes. For U2-type introns, it is selectively and specifically required for the second step of splicing. {ECO:0000269PubMed:21041408, ECO:0000269PubMed:9237760}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:15146077}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. {ECO:0000269PubMed:9237760}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 41 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR000571 Zinc finger, CCCH-type IPR003954 RNA recognition motif domain, eukaryote IPR009145 U2 auxiliary factor small subunit |
||||||||||||||||||
PFAM |
PF00076
PF00642 |
||||||||||||||||||
PRINTS |
PR01848
|
||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00356 SM00361 |
||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q15696 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q15696 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8233 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.631208 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005080 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:23019 | ||||||||||||||||||
OMIM | 300028 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14172 | ||||||||||||||||||
HPRD | 02068 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC004106 AC096510 BC113454 BC113480 D49677 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAI13455 AAI13481 BAA08533 | ||||||||||||||||||