Homo sapiens Protein: LNX1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-480635.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LNX1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | ligand of numb-protein X 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000426445 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-18546 (LNX1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase that mediates ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of NUMB. E3 ubiquitin ligases accept ubiquitin from an E2 ubiquitin-conjugating enzyme in the form of a thioester and then directly transfers the ubiquitin to targeted substrates. Mediates ubiquitination of isoform p66 and isoform p72 of NUMB, but not that of isoform p71 or isoform p65 (By similarity). {ECO:0000250}.Isoform 2 provides an endocytic scaffold for IGSF5/JAM4. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in heart, placenta, kidney, pancreas and brain. {ECO:0000269PubMed:11521506}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 173 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001841
Zinc finger, RING-type IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF00097 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00184
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8TBB1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8TBB1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RB76 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 84708 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.629493 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6657 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609732 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | 17287 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC058822 AC095040 AC124017 AF237782 AK056823 AY358326 BC022983 BC034737 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH22983 AAH34737 AAK15039 AAQ88692 AAY41000 BAB71291 | ||||||||||||||||||||||