Homo sapiens Protein: RNF19A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-484193.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RNF19A | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | ring finger protein 19A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RNF19; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000428968 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30691 (RNF19A) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin-protein ligase which accepts ubiquitin from E2 ubiquitin-conjugating enzymes UBE2L3 and UBE2L6 in the form of a thioester and then directly transfers the ubiquitin to targeted substrates, such as SNCAIP or CASR. Specifically ubiquitinates pathogenic SOD1 variants, which leads to their proteasomal degradation and to neuronal protection. {ECO:0000269PubMed:11237715, ECO:0000269PubMed:12145308, ECO:0000269PubMed:12750386, ECO:0000269PubMed:15456787, ECO:0000269PubMed:16513638}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000305}. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome {ECO:0000269PubMed:11237715, ECO:0000269PubMed:12145308, ECO:0000269PubMed:12750386, ECO:0000269PubMed:15456787}. Note=Present in the hyaline inclusion bodies specifically found in motor neurons from amyotrophic lateral sclerosis patients. Present in the Lewy bodies specifically found in neurons from Parkinson disease patients. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed, with highest levels in heart. Ubiquitously expressed in the central nervous system. {ECO:0000269PubMed:11237715}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 22 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001841
Zinc finger, RING-type IPR002867 Zinc finger, C6HC-type |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF01485 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00184
SM00647 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9NV58 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9NV58 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E7ETB2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 25897 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.735657 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_056250 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:13432 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 607119 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6286 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06176 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB029316 AB271913 AB271914 AC025647 AJ242975 AK001774 AK023455 AK027070 AL110253 AL122096 AP001574 BC093938 BC093940 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH93938 AAH93940 BAA91900 BAB14581 BAB15647 BAB39353 BAF48116 BAF48117 CAB45132 CAB53700 CAB59264 | ||||||||||||||||||||||