Homo sapiens Protein: KDM4C | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-49008.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM4C | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | lysine (K)-specific demethylase 4C | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000370710 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-49006 (KDM4C) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 9' and 'Lys-36' residues of histone H3, thereby playing a central role in histone code. Does not demethylate histone H3 'Lys-4', H3 'Lys-27' nor H4 'Lys-20'. Demethylates trimethylated H3 'Lys-9' and H3 'Lys-36' residue, while it has no activity on mono- and dimethylated residues. Demethylation of Lys residue generates formaldehyde and succinate. {ECO:0000269PubMed:16603238}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00537}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Overexpressed in several esophageal squamous cell carcinomas (ESCs). {ECO:0000269PubMed:10987278}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001965
Zinc finger, PHD-type IPR002999 Tudor domain IPR003347 JmjC domain IPR003349 Transcription factor jumonji, JmjN IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR020822 Chorismate mutase, type II |
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PFAM |
PF00567
PF02373 PF08007 PF02375 PF01817 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00249
SM00333 SM00558 SM00545 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9H3R0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9H3R0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9J879 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23081 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.734829 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_055876 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17071 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605469 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6471 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 12016 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB018323 AB037901 AK304032 AK310439 AL137020 AL161443 AL354707 AL445592 AL513412 BC104859 BC104861 BC143571 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI04860 AAI04862 AAI43572 BAA34500 BAB16102 BAG64946 CAH73283 CAH73284 CAI16322 CAI16323 CAI39606 CAI39607 CAI39608 | ||||||||||||||||||||||